項目概況
項目背景
隨著冷凍電鏡應用的不斷發展,單顆粒冷凍電鏡成為了結構生物學研究的重要手段之一,但模型重構通常需要對幾萬甚至幾十萬張投影圖片進行分析、組裝和優化,計算量十分龐大。
由月新生科構建的冷凍電鏡方案,最初采用多核多線程的CPU服務器進行計算,漫長的計算時間嚴重阻礙了后續實驗進展。但隨著冷凍電鏡生態優化,大量軟件已支持GPU計算加速,為進一步加速實驗中數據的二維和三維處理時間,現需對傳統冷凍電鏡方案進行異構升級。
解決方案
針對客戶的異構計算需求,結合冷凍電鏡實際科研場景需求,超集信息為其提供了基于EMR/SPR平臺的高性能液冷工作站解決方案——ServMAX? TL40-X5。
通過雙路EMR/SPR及4張專業級GPU搭載,TL40-X5單機可達128核心256線程及5940TFLOPS混合算力。在至強平臺高頻高核的算力支撐下,數據集準備、已處理得到高效優化,GPU則利用強大的浮點運算能力和并行處理能力實現了冷凍電鏡三維重構軟件的大幅提速,大大縮減了圖像分析、三維重構所需時間。
并且,環溫28℃條件下,TL40-X5 的 CPU 和 GPU 滿載運行溫度穩定在 75℃ 以下,且整機滿負荷噪音低于50dB,待機噪音更低至42dB,避免降頻風險同時,進一步實現了科研環境條件的優化。
客戶價值
相較傳統CPU方案,搭載GPU的異構平臺大大提升了數據處理效率,面對200 萬左右顆粒的二維分類,每一輪次處理時間僅需 30-50 分鐘,時間縮減約97.5%,2000張照片的整體處理時間可以縮短到2-5天,時間縮減約85%。并且,超集信息液冷方案憑借更高的算力密度和更低的環境噪音,使冷凍電鏡科研人員有了更佳的使用體驗。